新山福建会馆教育组成立于1965年，当初成立教育组的目的可分为两个重点，其一是给于及资助本区华文独中与华文小学经济和物质上的支持，其二为设立会员子女奖/助/贷学金，帮助家境贫寒的会员子女能够继续深造。
新山福建会馆会员子女奖助学金是由先贤叶受祯发起，并于1969年创设。至今已经50余年。叶老先生当时还率先认捐了RM1,000大元作为号召，开始时的目标订为RM100,000，经过历届理事会的推动下，至今连利息累积在内，基金已经超过百万令吉，并拥有国家税收局颁予的教育基金免税证。
此基金的成立主要目的是为了推动福建会馆会员子女的教育千秋大业，协助莘莘学子提高教育素质和学术水平，提供福建清寒子弟奖助学金协助有志继续深造但家境贫寒之会员子女，以期培育英才，造福社会国家。
1977年，成立贷学金。时至今日以免息贷款的方式，每年提供每名申请者RM5000到RM15000的贷款，帮助他们完成大学学业。
1990年设立图书馆，是当时新山少数几所设有图书馆的社团之一，当时图书馆的使用对象主要是中学生，同时也开放给各界人士使用。
2015年，本会向泉州华侨大学争取到每年5份的全免奖学金名额，让会员子女有机会在无需缴付任何费用下到该大学就读。
2016年，适逢丹斯里郭鹤尧的一百岁冥诞，为了纪念丹斯里郭鹤尧对本会馆及新山华社的贡献，特从教育基金拨出五十万令吉的款项成立了《新山福建会馆丹斯里郭鹤尧教育基金》。
2024年，本会也从《新山福建会馆丹斯里郭鹤尧教育基金》中，拨出一部分款项成立《柔南闽籍先贤史料》研究项目。此项研究工作目的皆在发掘柔南闽籍先贤们在这片土地所留下的痕迹。同时， 也为相关学术人员在研究本区域华人史料方面提供资金，相关空间或器材辅助。使其更容易开展史料研究工作，培育史料研究后继人才。
截至2024年，本会不断的提高了奖励金的颁发数额，小学组从早期的RM75增加到 RM150;初中组是从RM150增加到RM250;高中组从RM200增加到RM300;初中会考奖励金从RM150增加到 RM250;高中会考奖励金从RM200增加到RM300。
同时，本会也洞悉到许多会员子女在课外活动上也有着非凡的成绩。考虑到课外活动成绩在学习上的重要性。也将奖励金颁发区块从原有的学业奖励金划分为《学业优异奖励金》与《课外活动卓越 奖励金》。奖励在各个方面有着不俗成绩的会员子女。
如今，本会董事们更群策群力的将原本只局限在协助清寒会员子女的助学金推广至协助柔南区各个有需要的学校，并取名为《福苗计划》。(福苗计划现由会员福利组管辖，详细内容请查看福利组简介)
近年来，会馆奖学金每年颁发的款项皆在数万令吉左右，若加上《福苗计划》，贷学金等等。新山福建会馆每年拨出超过十万元做为教育用途。如此庞大的开销仰赖于本会馆辖下新山福建会馆洪仙大帝奉祀委员会，各界热心人士的捐助及每年游神衣的乐捐所得维持。
福建会馆教育基金的设立到今天，其中受惠人士不计其数。我们也始终谨记先辈们当初创立教育基金的初衷，善用每一分资源，将其散播至所需的地方，持续灌溉这一片土壤！